新しい病院の名称は公募で寄せられた228件を参考に決定されたもので、県立日本海病院が日本海総合病院に、市立酒田病院が日本海総合病院医療センターとなりました。
2008年4月に設立される法人の名称は地方独立行政法人山形県・酒田市病院機構とし、理事長には酒田病院長の栗谷義樹氏が 副理事長には日本海病院長の新澤陽英氏が内定しました。